酷卡特 發表於 2022-2-18 10:10:36

R语言绘制Facet violin plot小提琴刻面图实现示例

<div id="navCategory"><h5 class="catalogue">目录</h5><ul class="first_class_ul"><li>Step1. 绘图数据的准备</li><li>Step2. 绘图数据的读取</li><li>Step3.绘图所需package的安装、调用</li><li>Step4. 绘图</li><li>Step5.美化</li></ul></div><p>老铁们，许久未见啦。顺便说一下，最近可不是小仙同学偷懒哟，电脑上个月送修今天刚刚拿回来(想买联想Yoga的同学先问问自己会不会拆电脑换排线，我买的这台用了一个月，送修也用了一个月 )。<br />最近我可攒了个大招呢，先来看看下面这张图，有没有很眼熟呢？</p>
<p style="text-align:center"><img alt="在这里插入图片描述" src="https://img.jbzj.com/file_images/article/202202/2022021809552521.png" /></p>
<p>这张图在开始介绍R语言的时候就出现过啦，不过小仙同学当时并不知道怎么画。今天可以秀一把啦。</p>
<p class="maodian"></p><h2>Step1. 绘图数据的准备</h2>
<p>老样子，准备好要作图的csv文件。<br />数据的格式如下图：列表示一种变量(特征)，第一行是列名<br />a1~a9表示9种基因，TypeA~TypeC表示三种不同的细胞</p>
<p style="text-align:center"><img alt="在这里插入图片描述" src="https://img.jbzj.com/file_images/article/202202/2022021809552622.jpg" /></p>
<p class="maodian"></p><h2>Step2. 绘图数据的读取</h2>
<div class="jb51code"><pre class="brush:ruby;">data&lt;-read.csv(“your file path”, header = T)    #注释：header=T表示数据中      
                              的第一行是列名，如果没有列名就用header=F
</pre></div>
<p class="maodian"></p><h2>Step3.绘图所需package的安装、调用</h2>
<div class="jb51code"><pre class="brush:ruby;">#注释：大家要注意今天要用的package安装比较特别哟
install.packages("devtools")                  
library(devtools)
install_github("kassambara/easyGgplot2")
library(easyGgplot2)
#注释：今天还要用到一个新的函数，reshape2里的melt函数，可以把宽数据变成长数据
install.package("reshape2")
library(reshape2)
df&lt;-melt(data,id.vars = c("type"))
</pre></div>
<p class="maodian"></p><h2>Step4. 绘图</h2>
<div class="jb51code"><pre class="brush:ruby;">ggplot2.violinplot(data=df,xName='variable',yName='value',         #注释：xName表示x轴变量，yName表示y轴变量
                   groupName='variable', legendPosition="top",
                   faceting=TRUE,facetingVarNames="type")
</pre></div>
<p style="text-align:center"><img alt="在这里插入图片描述" src="https://img.jbzj.com/file_images/article/202202/2022021809552623.png" /></p>
<p class="maodian"></p><h2>Step5.美化</h2>
<div class="jb51code"><pre class="brush:ruby;">ggplot2.violinplot(data=df,xName='variable',yName='value',
                   groupName='variable', legendPosition="top",
                   backgroundColor="white",
                   removePanelGrid=TRUE,
                   axisLine=c(0.5, "solid", "black"),
                   faceting=TRUE, facetingVarNames="type")
</pre></div>
<p style="text-align:center"><img alt="在这里插入图片描述" src="https://img.jbzj.com/file_images/article/202202/2022021809552624.jpg" /></p>
<p style="text-align:center"><img alt="在这里插入图片描述" src="https://img.jbzj.com/file_images/article/202202/2022021809552625.png" /></p>
<p>Ps：如果想去掉边框可以加上这一句removePanelBorder=TRUE</p>
<p>到这里已经可以完成facet violin plot了，那么问题来了，怎么才能让图片变成下图这个样子呢？小仙同学用了个很笨的方法，下次分享揭晓答案哟！</p>
<p style="text-align:center"><img alt="在这里插入图片描述" src="https://img.jbzj.com/file_images/article/202202/2022021809552626.png" /></p>
<p>以上就是R语言绘制Facet violin plot小提琴刻面图实现示例的详细内容，更多关于R语言绘制Facet violin plot小提琴刻面图的资料请关注琼殿技术社区其它相关文章！</p>
                           
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